A sua missão centra-se na criação e transferência de conhecimento através de investigação aplicada, organizada em cinco linhas temáticas: (i) Educação de Qualidade; (ii) Sustentabilidade Social e Empreendedorismo; (iii) Sistemas Agroalimentares Sustentáveis; (iv) Atividade Física e Desporto; e (v) Determinantes Sociais e Indicadores de Saúde.

O CIEQV desenvolve atividades de investigação multi e interdisciplinar para abordar questões críticas que afetam o bem-estar humano, como educação de qualidade ao longo da vida, cuidados de saúde, e sustentabilidade ambiental e social. Com este intuito, o centro promove a colaboração entre investigadores, apoia os investigadores em início de carreira e estabelece parcerias com vários setores para facilitar a aplicação prática dos resultados da investigação.